El ICMAT está situado en un nuevo edficio con inmejorables recursos para la investigación matemática. Se localiza en el campus de Cantoblanco de la Universidad Autónoma de Madrid, y la cercanía con el departamento de matemáticas de la UAM facilita una estrecha colaboración entre los investigadores de ambas instituciones.
El edificio alberga seis aulas de congresos (que pueden acoger hasta 30, 40, 50, 80 ó 140 personas), y un espléndido salón de actos con capacidad para 270 personas. Todos ellos están equipados con pizarras, pantallas y proyectores, beamer, acceso a internet, y equipo multimedia que permite grabar las exposiciones.
El ICMAT tiene más de un centenar de despachos totalmente amueblados, que dan cabida a más de 200 personas. Un buen número de estos despachos están reservados para visitantes eventuales. Además, el ICMAT tiene una gran sala común equipada con 24 mesas y ordenadores, con lo que el ICMAT puede albergar tantos como 50 ó 60 invitados al mismo tiempo.
